新农合（新型农村合作医疗制度）在市医院报销的流程通常包括以下几个步骤：
参保患者在市级医院住院时，需使用医疗保险IC卡到医院的医疗保险管理窗口办理出入院登记手续。
出院时，医院会开具费用汇总清单、费用明细、住院发票等。
如果是异地住院，患者需要提供转院手续。
患者需要准备以下材料：住院发票、费用清单、出院记录、转诊证明、身份证复印件或户籍证明等。
将上述材料提交至参保所在地的乡镇合管所进行审核。
审核通过后，乡镇合管所将申请材料集中统一送交市农保业务管理中心。
市农保业务管理中心对提交的材料进行审核，并将报销金额转入参保人指定的账户。
请注意，具体的报销比例和起付线标准可能因地区而异，建议咨询当地新农合管理部门获取最新信息。此外，意外伤害等特殊情况的报销可能需要额外的审核流程。
