申请农田保护通常涉及以下步骤：
登记公示：村（居委会）负责辖区内补贴面积逐户登记核实，公示无异议后分户面积统计表报至镇街农业站。
汇总上报：镇街农业站进行审查汇总，纸质汇总表经相关负责人签字和镇人民政府、街道办事处盖章后，由镇街农业站送市财政局农业科和种植业管理局粮油站（各一份原件），同时报送电子档。
市财政局会同农业农村局汇总各镇街上报面积，根据省财政下达的资金指标，测算当年农业支持保护补贴全市统一发放标准，通知各镇街。
编制录入：镇街农业站与财政分局（所）配合，依据补贴标准编制发放清册，并录入“一卡通”系统。
审核：镇街财政分局（所）及时审核，提交市级审核（种植业管理局粮油站审核后提交财政局农业科审核）。
发放：市财政局在经过市级审核后，通过“一卡通”系统发放到户。
具体流程示例（以内蒙古呼和浩特市为例）：
农户通过惠民惠农财政补贴资金“一卡通”资格审批系统进行申报。
村经办人员将农户申报的信息录入系统。
申报信息在村进行公示，无异议后继续下一步。
