孩子有两个户口时，需要按照以下步骤进行注销：
首先，需要确认孩子确实存在两个户口，并了解每个户口的登记情况。可以通过查看户籍档案或咨询当地公安机关来确认。
基于教育资源、生活便利性等因素，选择一个对子女未来发展更有利的户口进行保留。这个选择应该由父母共同商议并达成一致。
携带相关证件，如身份证、户口本、出生证明等原件及复印件，前往当地公安机关。这些证件将用于证明要注销的户口的合法性和必要性。
向公安机关说明情况，并提交注销申请及所需材料。公安机关将审核材料并办理注销手续。在注销过程中，可能需要填写相关的注销审批表，并由社区或单位签署意见。
在注销户口后，及时更新子女的学校、医疗等机构的记录，确保子女的权益不受影响。例如，如果子女在注销的户口所在地有学籍，需要将学籍转移到保留的户口所在地。
根据户籍管理的法规，两个户口中非法登记的户口将被注销。父母不能选择注销哪一个户口，而是由户籍机关经核查后决定。
通过以上步骤，可以顺利完成孩子双重户口的注销手续，确保子女的户籍信息准确无误，并保障其合法权益。
