客车晚点不赔偿的主要原因是 目前没有明确的法律规定或政策要求运输公司必须对晚点进行赔偿。虽然旅客与铁路公司之间存在运输合同关系，且铁路部门因自身原因造成违约应承担相应赔偿责任，但我国相关法律法规并未对列车晚点赔偿做出明确规定。
具体来说，以下是一些可能导致客车晚点不赔偿的原因：
如果晚点是由于自然灾害、设备故障等不可抗力原因导致的，运输公司通常不需要承担赔偿责任。这些因素通常被认为是不可预见的，因此运输公司可以免除责任。
如果晚点是由于非运输公司过错的原因，例如自然灾害等不可抗力事件，运输公司可能不需要承担赔偿责任。在这种情况下，运输公司可能会提供改签或其他服务来弥补乘客的损失。
目前，无论是《铁路法》还是《铁路旅客运输规程》，均未对列车晚点赔偿做出明确规定。因此，铁路部门在处理晚点赔偿问题时，往往以“没有规定”为由拒绝赔偿。
有观点认为，铁路部门如果对每一起晚点都进行赔偿，将会面临巨大的经济压力。例如，如果晚点一分钟，按每人赔偿一块钱计算，对于一趟列车来说，赔偿金额可能会非常巨大。
一些情况下，铁路部门可能会提供其他形式的补偿，例如退还全部票款或安排改乘其他列车，而不是直接进行现金赔偿。
尽管如此，一些乘客和专家建议，鉴于乘客与铁路部门之间的合同关系，铁路部门应当在晚点发生时，向乘客提供详细解释，并在可能的情况下提供改签或其他补偿措施，以改善乘客的服务体验。
如果乘客对晚点赔偿有明确的要求，可以考虑通过以下途径解决：
如果晚点是因运输公司责任造成的，乘客可以收集相关证据，并向运输公司提出书面赔偿申请。
如果运输公司拒绝赔偿，乘客可以寻求法律帮助，通过法律途径维护自己的权益。
部分保险公司提供延误险服务，乘客可以通过购买此类保险来获得晚点赔偿。
总的来说，虽然目前没有明确的法律规定要求客车晚点必须进行赔偿，但乘客仍可以通过其他途径争取自己的权益。
